Ο Γιάννης Στάνκογλου αποκάλυψε τον χωρισμό του από την Αλίκη Δανέζη Κνούτσεν με την οποία έχει αποκτήσει δύο παιδιά, σε συνέντευξή που παραχώρησε στο περιοδικό «Hello».
Σε ερώτηση για το αν υπάρχουν θέατρα που δεν έχει παίξει και στα οποία θα ήθελε πολύ να εμφανιστεί, ο ηθοποιός απάντησε: «Ναι, φυσικά. Φέτος, για παράδειγμα, θα παίξω στη Νικόπολη για πρώτη φορά. Από τα θέατρα όπου νιώθω πάντα ωραία να παίζω είναι της Δωδώνης, των Φιλίππων, της αρχαίας Μεσσήνης, το θέατρο Δάσους, που δεν είναι αρχαίο αλλά έχει μια ιδιαίτερη ατμόσφαιρα. Κάθε παράσταση είναι διαφορετική, ακριβώς λόγω του χώρου. Επίσης, στις περιοδείες έχουμε κοινό που είναι πιο αγνό και πιο ανοιχτό, έχει πιο άδολη χαρά».
Για το αν η οικογένειά του τον ακολουθεί στις περιοδείες του, ο Γιάννης Στάνκογλου ανέφερε: «Τα παιδιά μου, ναι. Έχω χωρίσει εδώ και τριάμισι χρόνια εξάλλου. Με τα παιδιά μου περνάμε όλο τον Αύγουστο μαζί, όπως και πέρυσι και πρόπερσι. Περνάμε έναν μήνα σαν μπουλούκι, gipsy kings. Τους αρέσει πάρα πολύ, τρελαίνονται. Έχουν γνωρίσει μέρη στα οποία πηγαίνουμε κάθε χρόνο, κόσμο σε αυτά τα μέρη που ξανασυναντούν».
Και τέλος, για το αν κάποιο από τα δύο παιδιά του έχει κάποια κλίση στις τέχνες, ο ηθοποιός σχολίασε: «Η κόρη μου, που είναι 14 ετών, πολύ ισχυρή. Έχει παίξει και στο θέατρο, στη “Μήδεια”, και τώρα είναι σε μια παράσταση που δεν έχει ανέβει ακόμη. Επίσης, πηγαίνει στο Μουσικό Γυμνάσιο, παίζει πιάνο, τσέλο και ταμπουρά. Γενικά, το έχει με τις τέχνες. Ο γιος μου είναι πιο μικρός, 9 ετών, και αγαπά πολύ το ποδόσφαιρο».